I District 9:s alternativa verklighet landade utomjordingar i Sydafrika på åttiotalet. Dessa insektsliknande varelser mottogs ungefär lika väl som en skäggig arab på väg genom USA:s passkontroll och har sedan dess tvingats bo i slum-områden. Två decennier senare ska hela kolonin, nu en miljonbefolkning, flyttas och när en privat organisation hyrs in för att göra jobbet svämmar känslorna över.